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免疫沉淀(IP)中重链/轻链干扰的成因

2025-11-03

在常规的IP-WB流程里,IP抗体(一抗)的种属与WB二抗的识别范围重叠,重链(~50 kDa)和轻链(~25 kDa)会被HRP-二抗直接识别,形成两条“幽灵带”。目标蛋白如果正好落在25–55 kDa区间,信号会被彻底掩盖。Fc片段是重链恒定区,小鼠IgG-Fc片段常被当作封闭剂或阳性对照,却进一步放大了这种串扰。


专用二抗的设计逻辑:把“识别”做成“不识别”

IP专用二抗的核心思路是“删除”Fc结合能力。厂家用胃蛋白酶切除完整IgG的Fc段,保留F(ab’)?,再定向偶联HRP。A25112这类货号在质检环节会加一道“IP flow-through”测试:把1 mg小鼠IgG先固化在Protein A珠上,用F(ab’)?-HRP孵育,化学发光值<0.05×10? RLUs才算合格。删除Fc后,二抗与IP抗体重链的亲和力下降3个数量级,WB条带干净到可以直接做灰度定量。


如何在WB阶段彻底屏蔽重链/轻链信号

  1. 一抗种属跳层:IP用兔抗,WB用鼠抗,再配兔F(ab’)?-HRP,重链50 kDa位置天然空白。
  2. 轻链也不放过:选抗小鼠IgG F(ab’)?只识别重链,再叠加一道抗小鼠κ轻链F(ab’)?,轻链25 kDa同步消失。
  3. 曝光时间缩短:F(ab’)?-HRP比完整IgG-HRP催化活性高20%,ECL显色30 s就能出峰,减少背景拖尾。

选购专用二抗的4个硬指标

  • 宿主与IP抗体严格错位:IP抗体是小鼠,WB二抗必须选非小鼠来源的F(ab’)?片段。
  • 酶标记密度:HRP摩尔比≥3,保证1:20 000稀释后仍能在1 min内出条带。
  • 质检报告里看“Fc交叉”项:数值越低越好,A25112的实测值是0.03%,行业天花板。
  • 是否预吸附:通过小鼠、人、大鼠血清吸附,把潜在交叉反应降到10??级别,多通道荧光WB也不会串色。

实验室常见误操作排查表

现象 可能原因 纠正措施
50 kDa仍出现弱带 IP抗体洗脱不彻底,Protein A珠残留 95 ℃加热10 min,离心后只取上清
25 kDa背景呈“拖尾” 封闭剂含牛IgG,与抗牛轻链交叉 换5%脱脂牛奶或BSA
目标带信号弱 F(ab’)?-HRP稀释过度 先1:5 000做梯度,再下调到1:2 000

把专用二抗写进SOP,审稿人不再质疑

在材料与方法段落直接注明:“WB detection was performed using mouse IgG Fc-fragment-specific F(ab’)?-HRP (Cat# A25112, lot# GR123456) to eliminate IP antibody heavy/light chain interference.” 编辑一眼就能判断数据可靠性,补实验返修率下降一半。