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PDGF-BB 技术参数全析:从蛋白骨架到质控阈值
2025-10-24
分子骨架:109 个氨基酸的同源二聚体
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单体 109 aa,理论分子量 12.3 kDa,二硫键连接后表观 24 kDa,非还原 SDS-PAGE 呈单带
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链间二硫 Cys43-Cys43 键长 2.05 ?,还原剂 DTT 10 mM 即可断开,单体条带 12 kDa 重现
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晶体结构显示二聚体呈“长椭球”轴比 3:1,流体动力学半径 2.4 nm,SEC 出峰体积对应 28 kDa
糖型占位:CHO 表达 vs 大肠杆菌
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CHO 表达在 Ser52 位带核心岩藻糖,糖链占比 8 %,表观分子量 30 kDa
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无糖基化大肠杆菌版本活性相同,体内半衰期缩短 30 %,价格降低 25 %
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做动物实验优先选 CHO 型,糖链延长血清 t1/2 至 5.2 h,减少注射频次
活性单位:EC50 绝对值与相对比
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Balb/c 3T3 细胞增殖 EC50 1.5 ng/mL,批间差 CV ≤ 5 % 视为合格
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人源间充质干细胞迁移 ED50 0.8 ng/mL,与 3T3 差异 1.9 倍,写方案时注明细胞类型
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1 mg 干粉理论活性 6.7 × 10^5 IU,用前以 EC50 校准,避免单位换算误差
纯度阈值:SEC-HPLC 单体 ≥ 98 %
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聚集体 ≥ 1 % 时,3T3 增殖曲线平台下降 10 %,EC50 右移 0.3 log
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还原 CE-SDS 重链 ≤ 1 %,轻链杂带 ≤ 0.5 %,确保无非特异刺激
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内毒素 ≤ 0.1 EU/mg,原代平滑肌细胞培养 48 h 无形态改变
亲和力常数:与 PDGFRβ 结合动力学
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SPR 测定 PDGF-BB 与 PDGFRβ 胞外区 KD 0.12 nM,kon 1.8 × 10^6 M^-1s^-1,koff 2.2 × 10^-4 s^-1
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与肝素共孵育后,表观 KD 降至 40 pM,肝素浓度 10 μg/mL 为最佳
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做芯片固定时,氨基偶联密度 3000 RU 给出最大响应,继续升高出现质量转移假象
热稳定性:Tm 值与保存期限换算
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差示扫描量热法给出 Tm 72 °C,10 mM 柠檬酸 pH 4.0 下降 8 °C
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40 °C 加速 4 周,活性保留 95 %,反推 4 °C 真实有效期 36 个月
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冻融 3 次 Tm 下降 1 °C,单体损失 ≤ 0.5 %,设定 5 次为红线
标签取舍:His vs 无标签
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C 端 6×His 便于 IMAC 一步纯化,SPR 固定使用 NTA 芯片,节省生物素化步骤
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无标签版本分子量准确,适合晶体学,避免金属离子干扰结晶条件
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做动物实验选无标签,降低免疫原性,小鼠重复注射 7 天未检出抗 His 抗体
质控参比:实验室“金批”建立
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选三批 GMP 级 PDGF-BB,混池后分装 50 μg/管,-80 °C 保存
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每季度与金批做平行增殖实验,EC50 差异 ≤ 5 % 视为系统稳定
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金批用完前 6 个月启动新一轮混池,保持量值溯源链不断
单位换算:mg、IU、OD280 速查
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A280 0.55 对应 1 mg/mL,光程 1 cm
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1 mg 理论活性 6.7 × 10^5 IU,用前以 3T3 EC50 校准
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摩尔消光系数 11 500 M^-1cm^-1 每单体,二聚体换算乘 2